Das Repertoire der Wiener Sängerknaben reicht vom Mittelalter bis zu zeitgenössischer Musik. Motetten und Lieder für Oberchor bilden den
Kern des Repertoires, wie auch eigene Arrangements von Volksliedern und wienerischer Musik. Benjamin Britten, Petr Eben, Raoul
Gehringer, Ola Gjeilo, Elena Kats-Chernin, Heinz Kratochwil, Balduin Sulzer, Wolfram Wagner und Gerald Wirth haben Werke für den Chor geschrieben.
Jedes Jahr wirken die Sängerknaben bei Oratorien, Passionen und symphonischen Werken mit; mit den Wiener Philharmonikern,
den Wiener Symphonikern, der Londoner und der Osloer Philharmonie, der Staatskapelle Berlin und dem Pittsburgh Symphony Orchestra,
unter Dirigenten wie Christian Arming, Ivor Bolton, Philippe Jordan, Joana Mallwitz, Zubin Mehta, Riccardo Muti, Kent Nagano,
Christian Thielemann, Lorenzo Viotti, Simone Young. Zu den besonderen Highlights zählen die Mitwirkungen beim Neujahrskonzert
der Wiener Philharmoniker, zuletzt 2012 und 2016 unter Leitung von Mariss Jansons; 2023 unter Franz Welser-Möst.
Die Wiener Sängerknaben sind immer wieder bei Produktionen der Wiener Opernhäuser und der Salzburger Festspiele zu sehen;
vor allem in Mozarts Zauberflöte. Hin und wieder sind sie auch im Sprechtheater zu erleben - zuletzt in einer Inszenierung
von Thomas Bernhards "Jagdgesellschaft" im Wiener Akademietheater.